IPB telah bekerja sama dengan Kementerian Agama RI (Kemenag) sejak tahun 2005 dalam penerimaan mahasiswa jalur Beasiswa Utusan Daerah. Kerjasama ini disebut juga sebagai Program Beasiswa Santri Berprestasi (PBSB). Untuk mempererat dan memperkuat komitmen Penerima PBSB Kemenag, diadakan pembinaan pada tanggal 13-15 Desember 2013. Kegiatan dilaksanakan di Hotel Acacia Jakarta bagi 110 peserta yang terdiri dari pengelola beasiwa di perguruan tinggi, Pengurus CSS MoRA Nasional dan Pengurus CSS MoRA Perguruan Tinggi. Perguruan tinggi tersebut adalah : IPB, UPI, ITB, UGM,ITS, UNAIR, UNISMA, STAINU, UIN Syarif Hidayatullah, UIN Sunan Gunung Djati, IAIN Walisongo, UIN Sunan Kalijaga, IAIN Sunan Ampel, UIN Maulana Malik Ibrahim dan Universitas Surya Banten.